Ștefan Naubauer a obținut licența în științe juridice la Facultatea de Drept a Universității din București (2002), absolvind ulterior cursuri postuniversitare de specializare (Instituții constituționale și instituții politice, 2003), master (Drept social român și european, 2005) și doctorat (Dreptul muncii, 2011).
Și‐a început activitatea didactică în învățământul juridic superior în anul 2003, fiind în prezent lector universitar la Facultatea de Drept a Universității „Nicolae Titulescu” din București, titular al disciplinei Organizarea profesiilor liberale în cadrul programului de master Carieră judiciară. Din ianuarie 2004 este avocat pledant, membru al Baroului București, specializat în litigii de muncă.
Din anul 2005 este formator al Institutului Național pentru Pregătirea și Perfecționarea Avocaților (I.N.P.P.A.), titular la disciplina Organizarea și exercitarea profesiei de avocat. În anul 2010 a fost atestat ca formator al Institutului Notarial Român.
A îndeplinit funcția de director executiv adjunct al I.N.P.P.A. (2008‐2012), fiind în prezent șeful Departamentului de Studii, Cercetări Juridice și Cooperare Internațională al acestui institut.
A fost redactor șef al revistei Pandectele Române (2006‐2011). Din anul 2005 este redactor șef adjunct al Revistei Române de Dreptul Muncii. În același an a fondat împreună cu alți avocați Buletinul I.N.P.P.A., revistă pe care o conduce în prezent în calitate de redactor șef.
A publicat, ca autor sau în coautorat, peste 50 de studii, articole și note de jurisprudență. Între lucrările sale cu caracter monografic s‐au remarcat Comentariile noului cadru legal privind profesia de avocat (Editura Universul Juridic, Bucureşti, 2004, publicată în coautorat cu Tiberiu Savu) și Raporturile de muncă în cooperația meșteșugărească (Editura Universul Juridic, Bucureşti, 2012).
